MarvinSketch-peruskäyttö
MarvinSketchin "opetteluaikataulu"
MarvinSketchin käyttöä pitää opetella pienissä osissa. Tässä on yksi ehdotus:
1.kurssi
- Piirretään vesimolekyyli, siistitään se V-muotoon, merkitään siihen [[$ \delta + $]] ja [[$ \delta - $]]. Kopioidaan vesimolekyyliä ja piirretään vetysidoksia.
- Opetellaan siirtämään ja kääntämään vesimolekyyliä
- Piirretään ioneja ja piirretään ioni-dipolisidoksia.
- Tutkitaan molekyylin poolisuutta Charge-toiminnolla.
2.kurssi
- Piirretään perushiilivetyjä, opetellaan piirtämään viivakaavaa ja täydellistä kaavaa.
- Opetellaan nimeäminen.
- Opettellaan piirtämään funktionaalisia ryhmiä.
- Piirretään cis- ja transmuotoja ( E- ja Z-toiminto).
- Piirretään yhdisteitä joissa on asymmetrinen hiili ( R-ja S-toiminto).
- Haetaan massaspektri
- Haetaan Templatesta aminohappoja.
- MarvinSpace-tilaan pääseminen ctrl+shift+M
3.kurssi
- Piirretään orgaanisia reaktioyhtälöitä
- Piirretään dipeptidejä valmiiden amonohappojen avulla (Template). Selvitetään miten päin funktionaaliset ryhmät viedään päällekkäin jotta tulee peptidisidos.
4.kurssi
- Piirretään polymeerejä
5.kurssi
- Heikkojen happojen ja emästen tasapainoreaktiot
1.kurssi
- Piirretään vesimolekyyli, siistitään se V-muotoon, merkitään siihen [[$ \delta + $]] ja [[$ \delta - $]]. Kopioidaan vesimolekyyliä ja piirretään vetysidoksia.
- Opetellaan siirtämään ja kääntämään vesimolekyyliä
- Piirretään ioneja ja piirretään ioni-dipolisidoksia.
- Tutkitaan molekyylin poolisuutta Charge-toiminnolla.
2.kurssi
- Piirretään perushiilivetyjä, opetellaan piirtämään viivakaavaa ja täydellistä kaavaa.
- Opetellaan nimeäminen.
- Opettellaan piirtämään funktionaalisia ryhmiä.
- Piirretään cis- ja transmuotoja ( E- ja Z-toiminto).
- Piirretään yhdisteitä joissa on asymmetrinen hiili ( R-ja S-toiminto).
- Haetaan massaspektri
- Haetaan Templatesta aminohappoja.
- MarvinSpace-tilaan pääseminen ctrl+shift+M
3.kurssi
- Piirretään orgaanisia reaktioyhtälöitä
- Piirretään dipeptidejä valmiiden amonohappojen avulla (Template). Selvitetään miten päin funktionaaliset ryhmät viedään päällekkäin jotta tulee peptidisidos.
4.kurssi
- Piirretään polymeerejä
5.kurssi
- Heikkojen happojen ja emästen tasapainoreaktiot
Ohjeet piirtämiseen
Piirrä MarvinSkech-ohjelmalla
Käytä hyväksi ohjemonistetta sekä ohejvideoita
- Piirrä heksaani niin että kaikki vedyt ja hiilet näkyvät. Tee siitä viivakaava.
- Tee heksaanista 3-heksanoli. Hae sille nimi, molekyylikaava ja moolimassa.
- Tee 3-heksanolista 3D-malli.
- Tutki 3-heksanolin poolisuutta. Mittaa OH-ryhmän sidoskulma.
- Piirrä vesimolekyyli. Hae sille vapaat elektroniparit. Merkitse siihen [[$ \delta + $]] ja [[$ \delta - $]]. Valitse molekyyli ja copy-paste-toiminolla (Ctrl+c ja Ctrl+V) tee niitä useita. Piirrä niiden välille vetysidoksia.
- Hae kaksi amonihappoa ja piirrä kaikki mahdolliset dipeptidit.
- Piirrä rasvamolekyylin muodostuminen glyserolista ja cis-9-oktadekeenihaposista.
- Hae sykloheksaanirengas ja tee siitä glukoosi. Piirrä polysakkari.
- Piirrä mentoli (2-isopropyyli-5-metyylisykloheksanoli) ja tutki on siinä E/Z-isomeriaa ja asymmetristä hiiltä.