Muuttuneet eli metamorfiset kivilajit ovat syntyneet, kun muinaisten suurten vuoristojen syntyessä kalliokerrostumat ovat poimuttuneet ja niiden lämpötila ja paine kasvoi. Kallioperässä olevat mineraalit järjestyivät uudella tavalla ja aikaisemmin syntyneistä magma- ja kerrostuneista kivilajeista syntyi uusia, muuttuneita kivilajeja.

Suomen yleisin muuttunut kivilaji on gneissi, joka on syntynyt graniitista, eli niissä on samat mineraalit. Gneissi on selvästi juovikkaampi kuin graniitti ja mikäli mahdollista, vieläkin kestävämpi.

Suomen kovin kivilaji on kvartsiitti, joka on muuttunut hiekkakivestä. Se on monien korkeiden huippujen, kuten Kolin, kivilaji.

Pihalaattoina käytetty kiilleliuske on muodostunut savikivestä ja arvokas marmori kiteisestä kalkkikivestä.