Teemaopintoja toteutetaan vuorolukuperiaatteella opiskelijoiden valintojen mukaisesti. Opinnot toteutetaan hajautetusti, osittain itsenäisesti tai verkko-opintoja. Teemaopintojen sisältöjä on tarkennettu liitteessä Kuhmoisten yhtenäiskoulun teemaopinnot.