Valinnaisaineita opiskellaan vuosiluokilla 8-9 yhteensä 12 vuosiviikkotuntia (vvt). Varppeen koulussa valinnaisaineita on 8. luokalla kuusi tuntia: yksi pitkäkurssi taito- ja taideaineiden valinnaisia opintoja (laajuus 2 vvt, kaksivuotinen) ja kaksi pitkäkurssia valinnaisainetta (2vvt). 9. luokalla valinnaisaineita on kuusi tuntia: yksi pitkäkurssi (2 vvt, kaksivuotinen) ja yksi lyhytkurssi (1 vvt) taito- ja taideaineiden valinnaisia opintoja sekä yksi pitkäkurssi (2 vvt) ja yksi lyhytkurssi (1 vvt) valinnaisainetta.

Valinnaisainevalinnat tehdään keväällä seuraavaa vuotta varten. Kahdeksasluokkalaiset tekevät valinnat kolmannen jakson aikana ja seitsemäsluokkalaiset neljännen jakson aikana. Oppilaanohjaajat tiedottavat ja ohjaavat valinnoissa.