BI6.3 JHE jakso 5

Kertauskysymyksiä

Kertauskysymyksiä:
    
Luku 1: Juha
- Mikä on mikrobi/mikrobin määritelmä

- Missä taksoneissa esiintyy mikrobeja?  Missä eliökunnan eri osissa esintyy mikrobje?

- Mitkä ovat mikrobien keskeisimmät ryhmät?


- Mitkä ovat a) esitumallisia, b) tumallisia mikrobeja?


- Miten hiivasolu eroaa bakteerista/tumallisesta solusta?


- Miten malarialoisio lisääntyy? Mikä lis.kierron vaihe lisää  muuntelua? 

Luku 2 Greta:

- Bakteerin rakenne s. 18
    
-Millä eri tavoin bakteereja voidaan luokitella?

-Miten (/Missä) bakteereja kasvatetaan?

-Miten bakteerit lisääntyvät?

- Miten eri tavoin bakteerin perimä voi muuttua eli miten tapahtuu MUUNTELUA?
  • - mutaatiot näkyvät heti ( vain yksi kromosomi, geenit peräkkäin)
  • - rekombinaatio 

-Mitä eroa on laajakirjoisella ja kapeakirjoisella antibiootilla?

- Mikä on siraalabakteeri? Merkitys

-Mitä hyötyä bakteereilla ja arkeoneilla on ihmisille?

Luku3 Albert

- Mikä on virus?
- Nimeä virusten rakenne

- Minkälainen perimä viruksilla on? 

- Mikä on viruksen pintaproteiinien tehtävä? 

- Miten viruksia voidaan luokitella? Nimeä muutama virustyyppi

- Mitkä ovat virusten tautireittejä? 

- Kerro, miten eri virustyypit (DNA-, RNA-, retrovirukset ja bakteriofagit)  lisääntyvät, 

- Virusten muuutelutavat?


Luku 4 Milja

-Mitä eroa on tumattoman ja tumallisen perimässä?

-Mitä eroa on tumattoman ja tumallisen proteiinisynteesissä?

-Mitä operoniin kuuluu?

- Tumallisen eliön geenin rakenneosat ja niiden tehtävät!


-Miksi bakteerilla ei tapahdu silmukointia?

-Millä eliöillä on plasmideja? Bakteerit, hiivat, arkeonit

Luku 5 Ninni:
    
- Mitä tarkoitetaan geenitekniikalla (vert. biotekiikka) ja mitä sen avulla pystytään selvittämään?

- Mitkä ovat geenitekniikan keskeisimmät vaiheet?

- Miten entsyymit liittyvät geenitekniikkaan ja mihin niitä siinä tarvitaan?   Entsyymityypit?

- Miten DNA:ta monistetaan PCR-tekniikan avulla? q-PCR:t 
- Mikä on c-DNA eli vastin-DNA ja milloin sitä käytetään?

- DNA:n monistaminen bakteerissa: tumallisen intronit saa olla mukana
- Proteiinin tuottaminen bakteerissa: tumallisen intronit pois eli käytetään c-DNA:ta

- Mitä entsyymiä tarvitaan DNA:n monistamisessa? (Mitä entsyymiä tarvitaan esiaste-lähetti-RNA:n muod.?)

- Mikä on koetin? (edellytys, jotta osataan tehdä, rakenne, käyttö, ero alukkeeseen)

- Selitä DNA-elektroforeesin periaate, käyttö

Luku 6 Inka:
    
- Mitkä ovat geeninsiirron vaiheet?

- Miten geeninsiirtovektorit toimivat? Eri vektorit ja niiiden hyvät/huonot puolet

- Miten tehdään keinotekoinen kromosomi?
'
- Miten bakteriofagiin saadaan liitettyä DNA:ta?

- Miten varmistetaan geeninsiirron onnistuvuus?   !!!!!!!

- Mikä on CRISPR-tekniikka, miten sitä käytetään + käyttökohteet ....s. 74

Luku 7 Ming Hin:
    
-Mitä eroa on genomilla ja perimällä?

- Mitä sekvenssoinnilla tarkoitetaan?

- Mitä eroa on rinnakkais- ja satunnaissekvenssoinnilla?

- Mitä tarkoittaa geneettinen monimuotoisuus?

- Mitä tarkoittaa Bioinformatiikka ja genomiikka?

Luku 8:
- Mitä eroa on biometrisellä ja geneettisellä yksilöntunnistuksella

- Toistojaksot: sijainti, rakenne, käyttökelpoisuus

- SNP: rakenne, sijainti, käyttö?

- DNA-profiili?

Luku 9:
- Erilaiset (perinteiset) jalosmenetelmät, esimerkit, tapojen edut ja haitat
- HUOM. Lisääntymisbiologiset menetelmät (sukusolut)
- Huom. haploidiajalostus
Luku 10:
- Geenitekniset (uudet) jalostusmenetelmät, ks. tiivistelmä

- esim. Dolly (kloonaus tumansiirtomenetelmällä)

Luku 11:
- Bioteollisuuden määritelmä, esimerkit, tiivistelmä
Luku 12:
- Mikä on geenitesti (miten tehdään, edellytykset, rakenne, merkitys/esimerkit)
  • - käyttö geenivirheen etsinnässä
  • - käyttö aktiivisen geenin estinnässä tietyssä kudoksessa tietyllä hetkellä?
    • - ensin eristetään  lähetti-RNA (silmukoitunut) , josta tehdään käänteiskopioijaentyymin  avulla c-DNA (= vastin-DNA = komplementaarinen DNA
- DNA-siru ?
- poistogeenisen hiiren tekeminen CRISPR-tekniikalla
Luku 13:
- rokottamisen periaate
- antigeenit: rakenne, merkitys, käyttö, tuottaminen
- rokotetyypit: perinteiset + RNA-rokotteet
- iPS-solut (tuottaminen ja käyttö)
- geenitekiikkaa syöpähodossa
    
(Luku 14), bioetiikka (arvot, etiikka, moraali)


Aikataulu


Opintojakso: BI6.3

Tunnit: ti 11.45-13.00, ke 13.15-14.30, pe 09.50-11.05

 

Nro

Päivä

Aihe

Erityistä

1

ti 9.4.

Esittäytymiset, sis. ja tav., toiveita, arviointi,
digikirjan toimivat ominasuudet (alleviivaus, muistiinpanokuplat)
omien muistiinpanojen merkitys (oma muokkaus),
jokaisen kappaleen lopussa keskeisimmät käsitteet
kirjaan omat, siistit merkinnät (kirja käytössä ylppäreihin asti)

Mikrobien luokittelu/asema eliökunnassa tumalliset ja tumattomat ja taksoneittain tarkasteltuna (domeenit, kunnat, kaaret)
- malarialoision elinkierto (suvuton vaihe ihmisen maksassa ja punasoluissa sekä suvullinen vaihe hyttysen ruuansulatuselimistössä koiras- ja naaraspuolisten sukusolujen avulla), s. 13 kuvasarja

Käy kirjautumassa Kampukseen avaimella 2ZBA

 

ke 10.4.

2

 

 

pe 12.4.

3

 

 

ti 16.4.

4

 

 

ke 17.4.

5

 

 

pe 19.4.

6 aloitus/läpikäynti/johdanto, läksynä: monisteen täydentämistä (+ teht.)

 

 

ti 23.4.

6 jatkuu/loppuun/tehtäviä + 7 + muutama tehtävä

 

 

ke 24.4.

8

 

 

pe 26.4.

Ryhmänohjaus, BI6 alkaa klo 10.20

 

 

ti 30.4.

10

 

 

pe 3.5.

11

 

 

ti 7.5.

12

 

 

ke 8.5.

12

 

 

pe 10.5.

13

 

 

ti 14.5.

13 loppuun: iPS, vasta-aineet ja virukset syövän hoidossa,
+ 14 

 

 

ke 15.5.

kertaus/täydennys osa 1

 

 

pe 17.5.

kertaus/täydennys, osa 2

 

18

ti 21.5.

koe Greta, Albert, muille harjoituskoe/koe

 

 

ti 28.5.

koe

 

 

elokuu

uusinta

 

BI6 tuntirunkoja yms.