Erot aineiden fysikaalisissa ja kemiallisissa ominaisuuksissa johtuvat atomien erilaisesta sitoutumisjärjestyksestä tai molekyylin muodosta. Isomeriailmiö on hyvin yleistä orgaanisilla aineilla, mutta sitä esiintyy myös epäorgaanisilla yhdisteillä. Isomerian jaotellaan kahteen pääryhmään: rakenneisomeriaan ja stereoisomeriaan