Yläkoulujen oppilaanohjaajat, jotka ovat pedagogista henkilökuntaa, toimivat tiiviissä yhteistyössä oppilashuollon ammattilaisten kanssa. Erityisesti yhteistyötä tehdään koulutuksen siirtymävaiheissa kuudennelta seitsemännelle vuosiluokalle sekä perusopetuksen ja toisen asteen nivelvaiheessa. Yhteistyötä kuvataan tarkemmin ohjaussuunnitelmassa.