Haapajärvellä esiopetuksen pedagoginen johtoryhmä (EOPJ) vastaa esiopetuksen pedagogisesta suunnittelusta ja toteutuksen arvioinnista. Esiopetuksen pedagogisen johtoryhmän tavoitteena on luoda keskustelufoorumi, jossa keskustellaan yhdessä esiopetuksen pedagogiasta. EOPJ vastaa myös yhteistyön kehittämisestä varhaiskasvatuksen, esiopetuksen yksiköiden sekä alkuopetuksen välillä. Johtoryhmä kokoontuu neljä kertaa lukuvuodessa ja vastaa toiminnastaan Haapajärven sivistystoimen johtoryhmälle. Esiopetuksen hallinnollisesta johtamisesta vastaa kunkin esiopetusyksikön rehtori/koulunjohtaja. Esiopetuksen johtoryhmä koostuu esiopettajista, erityisopettajasta, luokanopettajasta sekä varhaiskasvatuksen edustajasta. Puheenjohtaja valitaan vuosittain.