Biokemia on useita eri tieteenaloja yhdistävä tiede, jossa tutkitaan proteiineja. Biokemiassa yhdistyvät kemian, biologian ja lääketieteen osaaminen. Biokemistit nimeävät aminohapot kolmikirjaimisin lyhentein. Esimerkiksi aminoetaanihapon lyhenne on GLY (glysiini) ja aminopropaanihapon vastaavasti ALA (alaniini). Kaikissa biologisesti tärkeissä aminohapoissa aminoryhmä -NH2 on liittynyt välittömästi karboksyyliryhmän viereiseen hiiliatomiin.

Proteiineja voidaan tutkia tietokoneilla

Seuraava video havainnollistaa miten molekyylimallinnusohjelmistolla optimoidaan molekyylirakenteita. Insuliinimolekyylin kaksiulotteinen (2D) muoto on tuotettu yhdellä tietokoneohjelmalla ja se muokataan kolmiulotteiseen muotoon (3D) toisella ohjelmalla. Muokkaaminen perustuu molekyylien rakennetutkimuksiin. Tietokoneohjelmien laskentaa ja energeettisesti edullisimman rakenteen etsimistä sanotaan optimoinniksi. Sitä tarvitaan, koska optimoitu rakenne vastaa paremmin molekyylin todellista muotoa. Jos molekyylin muoto tunnetaan, niin tiedetään myös, miten se vaikuttaa elimistössä. Silloin siitä voidaan suunnitella esimerkiksi oikein toimivia lääkeaineita.