Useat asiat todistavat, että eliöt ovat kehittyneet aikaisemmista muodoista. Joistain todisteista tutkijat tosin ovat eri mieltä.

1. Fossiilit

Fossiilit ovat muinoin eläneiden eläinten jäänteitä. Fossiilit muodostuvat, kun eliö kuollessaan jää hapettomaan tilaan, eikä hajoa. Fossiileja on erilaisia, esim.

- kivettymäfossiilit
- jäätyneet fossiilit
- meripihkafossiilit
- asvalttisuofossiilit

2. Samanlaiset rakenteet

Monilla selkärankaisilla on samantyyppiset raajat (jalat, kädet). Tätä pidetään todisteena siitä, että nisäkkäillä on ollut yhteinen kantamuoto, josta ne ovat kehittyneet.

3. Surkastumat

Esimerkiksi ihmisellä on häntäluu. Tätä pidetään merkkinä siitä, että ihminen on kehittynyt sellaisesta kantamuodosta, jolla on ollut häntä. 

4. Geenit

Lähisukulaisilla, kuten ihmisellä ja simpanssilla, on hyvin samankaltaiset geenit. Tämä osoittaa, että meillä on yhteinen kantamuoto ja olemme lähteneet kehityksessä eri teille vasta aika hiljattain. Meillä on paljon samalaisia geenejä myös esim. hiiren kanssa, mutta vähemmän kuin simpanssin kanssa. Olemme siis lähteneet kehittymään eri suuntiin hiiren kanssa paljon aikaisemmin kuin simpanssin kanssa.