Jaettu valo - Shared light

Mistä on kyse?



Projektin keskiössä ovat valoaktiiviset AAP-bakteerit, aerobiset, fotosyntetisoivat mutta happea tuottamattomat bakteerit, jotka on löydetty vasta aivan viime vuosina myös kasvien lehdistä - aiemmin niitä on tunnistettu vesiympäristöistä. AAP-bakteerit (aerobic anoxygenic phototrophic bacteria) käyttävät valon vihreitä ja lähi-infrapuna-aallonpituuksia, joita isäntäkasvit eivät hyödynnä.
Jaettu valo -projektissa selvitämme näiden kasvien mikrobikumppanien levinneisyyttä ja toimintaa - tieteelle uusia asioita!

Mukaan osallistuvat lukiot

- keräävät projektin tutkijoille kasvimikrobinäytteet eri vuodenaikoina alkaen elokuu 2021 - toimivat kansalaistieteen tekijöinä
- jakavat kokemuksiaan ja havaintojaan projektin Instassa ja Peda.netissa

- voivat halutessaan
*hyödyntää kursseillaan/opintojaksoillaan projektissa tuotettuja oppimateriaaleja
*tehdä projektiin liittyen monialaisen opintokokonaisuuden, jossa teemana VALO biologian, fysiikan ja taiteen näkökulmista
*osallistua yhteisiin etäseminaareihin





Osallistujien ensimmäisen lukuvuoden 21-22 yhteisten Zoom-tapaamisten 5.5.2021 ja 19.5. 2022 tallenteet löytyvät näiltä sivuilta, ylhäältä vasemmalta.
Pääset ne katsomaan sivujemme salasanalla.

Tervemenoa metsään!

Näytteenottoon metsään

Tämän projektin tiimoilta lukuvuonna 2021 - 2022:
1. kerta elokuussa 2021
2. kerta (loka-)marraskuussa 2021
3. kerta helmikuun puolivälin - maaliskuun puolivälin 2022 tienoilla
4. kerta toukokuussa,

ja sama rytmi lukuvuonna 2022 - 2023.



Näytteenottoon tarvittavat materiaalit lähetämme projektiin osallistuville lukioille kylmälaukussa. Ilmoita Ahtille mieluiten kaksi viikkoa aiemmin - tai heti kun tiedät - päivä jolloin näytteenoton koulussanne teette, kiitos. (Tarkemmin näytteiden lähetyksestä vasemmalla valikossa otsikolla Näytteiden lähetysohje.)




1. Diat: Jaettu_valo_diasarja1_lukioille_esittely_ja_näytteet.pdf
joissa
- Projektin esittely ja tavoitteet
- Ohjeet metsään ja näytteiden keruun ohjevideoiden linkit
- Lista tarvikkeista, joista suurimman osan saatte Jyväskylän yliopistolta
- Näytteiden lähetys Jyväskylän yliopistoon (Huom! huhtikuussa 2022 Alli vaihtui Ahdiksi)
Näet lähetysohjeet myös täältä Peda.netista ylhäältä vasemmalta, avautuu projektimme salasanalla.


2. Tehtäväkortit 2021-22 maastoon, ohjeet opiskelijoille : Jaettu_valo_tehtäväkortit_18.6.21.pdf
sekä
lomakkeetJaettu_valo_maastolomakkeet_18.6.21.pdf
jotka molemmat ovat myös valmiiksi printattuna kylmälaukussa.




3. Linkit opetusvideoihin - samat kuin yllä diasarjassa:

Video 1 Jaettu valo -projekti ja näytteenoton valmistelut
Video 2 Näytteenottopaikan havainnointi
Video 3 Näytteenotto männystä, kuusesta ja koivusta
Video 4 Näytteenotto mustikasta ja puolukasta
Video 5 Näytteenottopaikan mittaukset talvella
Video 6 Lämpötilaloggerin asettaminen

Ja samat in english, englanniksi tekstitettyinä:
Video 1 Video 2
Video 3 Video 4
Video 5 Video 6

Mukavaa ja mielenkiintoista metsäretkeä näytteenoton merkeissä toivottaen!



Näytteiden keruun jälkeen:

*Antakaa palautetta näytteenotosta - niin opiskelijat kuin opetkin - kiitos:
Palaute näytteenoton ohjeista ja näytteenotosta

*Palauttakaa maastolomakkeet palautuskansioon: vasemalla ylhäällä valikko, jonne sisään pääsee projektimme salasanalla. Palautukset pääsee tekemään, kun on kirjautuneena Peda.nettiin.

*Postatkaa kuvia Instaan ja tänne Pedaan valokuvien palautuskansioon: löytyy oikealla olevalta palstalta (tai kännykällä alhaalta, linkkien loppupäästä)

Voitte myös palauttaa lomakkeet ja valokuvat Katille sähköpostilla tai WhatsApp-viestillä - mikä vaan itsellenne helpointa on!

OPPIMATERIAALIT

Keskeiset heti projektin aluksi tarjolla olevat oppimateriaalit:

1. Lehtiprinttien teko - kasveissa elävien mikrobien kasvatus kasvatusalustoilla
(löytyy tämän postauksen alta, otsikolla BIOLOGIA)





2. Lehtiprinttikasvustojen valokuvaaminen kuvauslaitteella
(löytyy tämän postauksen alta, otsikolla FYSIIKKA)




3. Biotaiteen teko mikrobeilla
(löytyy tämän postauksen alta, otsikolla KUVATAIDE)





Tuotamme projektin edetessä lisää oppimateriaaleja - sisältötoivomuksia saa mielellään esittää!

BIOLOGIA

1. Lehtiprinttien teko





Linkki ohjevideoon tästä
ja sama in english, englanniksi tekstitettynä

Kouluille postitettavassa kylmälaukussa on printtien tekoon tarvittavat materiaalit - tietty itse näytteitä lukuunottamatta.

Näytteiksi voitte kerätä tutkimuslajeja ja/tai mitä vain kiinnostavaa.

Kun mikrobit alkavat kasvaa alustoilla, niitä on
- mielenkiintoista havainnoida ja vertailla an sich 
- kuvata kuvauslaitteella "normi"valossa ja "näkymättömässä" NIR-valossa: löytyykö AAP-bakteereita? -> katso ohjeet kohdasta FYSIIKKA
- tutkia näkymiä taiteilijan silmin

Diasarjassa esimerkkejä lehtiprinteistä: 
lehtiprintit.pdf





2. Kasvien mikrobiomeista



Riitan diasarja:

kasvien mikrobiomit_050521_info.pdf








3. AAP-bakteereista


Meri Mäkelän DIASARJA kandityöstään AAP-bakteerien havainnointi ja esiintyminen pohjoisissa ekosysteemeissä





4. Maailman DNA-päivä 25.4.




69 vuotta DNA:n rakenteen selvittämisestä!
Sivustollaan opetukseen monenlaista, eri ikäisille, esim.

Mikrobeista ja mikrobiomeista, sekvensoinnista, ihmisgenomin vaihtelevuudesta...:
15 Ways Genomics Influences Our World

Visuaaliset aikajanat
-Mendelistä Genomiprojektiin: Unlocking Life's Code -timeline
-erilaisten muinaisten eliöiden DNA-selvityksistä: ancient-dna-timeline

Videoita, mm. genomiprojektista:
Educational videos




5. Tutkimustehtävä AAP-bakteereista


Monilla opintojaksoilla biologiassa ja fysiikassa on mahdollisuus suunnitella ja toteuttaa pienimuotoinen tutkimus, joka jäljittelee tieteellisen tutkimuksen tekoa. Tässä vinkit, kuinka voisit tai voisitte ryhmänä toteuttaa tutkimuksen/kartoituksen AAP-bakteerien esiintymisestä - sekä kenties tutkia kasvustoja myös Taiteilijan silmin.

JaVa_tutkimustehtäväohje.pdf




FYSIIKKA

1. Kuvantamislaitteen käyttö



- Projektiin osallistuvat lukiot: mikäli haluatte kuvauslaitteen koulullenne, laittakaa Katille sähköpostia.


"NIRis" = Near-InfraRed imaging system:



Kuvausohjeet:

-Sallan opastamana videolla

-Kirjallisena:
NIR-kuvauslaite-opeohje-1.pdf


Mistä tässä on kyse


Häkkäsen Heikin kokoamalla kuvantamislaitteella voi ottaa mikrobikasvatusalustoista kuvia 

  1. normaalilla valkoisella valolla 
  2. UV-valolla, jolla AAP-bakteerien fotosynteesikoneisto virittyy ja näyttäytyy NIR-valona (near-infrared, eli lähi-infrapunasäteily, paljaalle ihmissilmälle normaalisti näkymätön "valo")

-> kasvatusalustalla mahdollisesti elävät AAP-bakteerit saadaan kuvissa näkymään meidänkin silmillemme.

- esimerkkinä tämän Peda.netimme otsikkokuvapari.

AAP-bakteerit (aerobic anoxygenic phototrophic bacteria) ovat pääosassa projektissa: missä ja milloin niitä esiintyy? Mikä niiden rooli kasveissa on?



 





2. Ihalaisen Jannen diasarja

Valon luonne ja biologiset systeemit


JAVA_koulu2021_valon_ominaisuudet-1.pdf


- saman diasarjan näet Jannen selostamana Zoom-tallenteesta 5.5.2021, joka löytyy täältä Pedasta ylhäältä vasemmalta projektimme salasanalla.







3. Pro gradu -tutkielmaesittely



Katri Ketola esittelee Pro gradu -tutkielmaansa Porkkanapigmentti bakteereissa, mitä tekee ja kuinka voidaan löytää - kts diasarja.




4. Tutkimustehtävä AAP-bakteereista



Monilla opintojaksoilla esim. fysiikassa ja biologiassa on mahdollisuus suunnitella ja toteuttaa pienimuotoinen tutkimus, joka jäljittelee tieteellisen tutkimuksen tekoa. Tässä vinkit, kuinka voisit tai voisitte ryhmänä toteuttaa tutkimuksen/kartoituksen AAP-bakteerien esiintymisestä - sekä kenties tutkia kasvustoja myös Taiteilijan silmin. Ohjeessa vinkkejä erityisesti biologian tutkimuskysymyksiin - fysiikkaan liittyen kehitelkää opintojaksojenne tiimoilta itse tai opettajan avustuksella.

JaVa_tutkimustehtäväohje.pdf

KUVATAIDE

Biotaide, bioart, agar-art, microbial art... tällä mainiolla on monta nimeä! 



1. Tilaa meiltä bakteerivärikantoja ja tee...




Yllä lueteltujen bakteerikantojen kantaviljelmät näyttävät tällaisilta:

(Kuvan kantaviljelmiin on tullut jo hieman kontaminaatiota, mutta kouluille pyritään toki saamaan puhdasviljelmät :)



Ohjeet agartaiteen tekoon opiskelijoille, printtaa tästä: Taidetta_bakteereilla_opiskelijaohje.pdf


Opelle materiaalit agartaiteen tekoon:


Opeohjeet agartaidetunnin valmisteluun: Agartaidetunnin valmisteluohje opelle.odt

 
 

Vinkkejä ja inspiraation lähteitä:


Tässä DIASARJASSA kuvavinkkejä
mitä tehdä voi - tai voi koittaa tehdä. Elävät, kasvavat olennot kun eivät usein käyttäydy kuten suunnittelee... mutta sehän juuri tekee biotaiteesta niin kiehtovaa: ei voi tietää, mitä teoksesta tulee. Netistä ja Instasta löydät hakusanoilla (biotaide, bioart, agar-art, microbial art) lisää huikeita esimerkkejä.



Video-ohjelinkki How to create agar art?










2. International Microorganism Day

17.9. vietetään kansainvälistä mikro-organismien päivää!

FEMS:in (Federation of European Microbiological Societies) sivuilta inspiraatiota ja vinkkejä: https://www.internationalmicroorganismday.org/



Päivään liittyy myös kilpailu:

https://fems-microbiology.org/microbe-art-competition-for-international-microorganism-day-2021/

joka järjestetään vuosittain. Kun kokemus tässä karttuu, niin kenties jonain tulevana syksynä kisailuun osallistuminen kiinnostaa ja innostaa.




3. ASM, American Society for Microbiology, järjestää myös vuosittain AgarArt-kilpailun:

https://asm.org/Events/ASM-Agar-Art-Contest/Home

A close-up of a keychain

Description automatically generated with low confidence

Kannattaa vilkaista, ja äimistyä.
Ja mikäli osallistuminen kiinnostaa, niin deadline lokakuussa (tai oli ainakin vuonna 2021).

Sivumme täydentyvät

Tulossa seuraavaksi, dioina ja osin videoina, ainakin

- Projektiin osallistuvien opiskelijoiden ja väitöskirjatutkijoiden töitä
- Syväntäviä sisältöjä aiheista oppitunneille
- Tutkimuksen etenemisestä ja tuloksista


... mitä toivoisit? Kerro Katille!

Peda.net käyttää vain välttämättömiä evästeitä istunnon ylläpitämiseen ja anonyymiin tekniseen tilastointiin. Peda.net ei koskaan käytä evästeitä markkinointiin tai kerää yksilöityjä tilastoja. Lisää tietoa evästeistä