Vaikka linnaleirijärjestelmä oli hyvä konsepti, kuten kaikki muut asiat, sitä usein väärinkäytettiin. Linnaleirimaksuja kerättiin kun sotilaat eivät ollut sodissa, talonpojat joutuivat tarjoamaan kyytejä armeijalle, ja maksamaan korkean määrän viljaa ja elintarvikkeita ratsusotilaille. Linnaleirijärjestelmämaksuja saivat periä kaiken, jotka olivat varustaneet ratsukon armeijalle, johon kuului pappeja, varakkaita talollisia, porvareita ja virkamiehiä. Verovapauksen lupauksen syystä ratsumiesten määrä Suomessa kolminkertaistui 1560-1590-luvun välisellä ajalla. Vääränkäytöksen syistä, myöhäiskeskiajalla, Suomen talonpojat alkoivat kapinoimaan, tavoittelemassa paremman elämän niille.