Lapijoen koululla järjestetään vuosittain joulu-/tammikuussa oppilaskunnan vaalit. Vaaleissa valitaan kultakin luokalta edustajat oppilaskunnan hallitukseen. Kunkin hallituksen toiminta-aika on yksi kalenterivuosi. Edellisen hallituksen 6.luokan oppilaat ovat hallituksessa mukana ns. tutorjäseninä kevätlukukauden loppuun ennen siirtymistään yläkouluun.