Suuri osa Kulkuri-verkkokoulun oppilaista opiskelee Kulkurissa vain suomen kieltä ja kirjallisuutta. Osa täydentää paikallisen tai kansainvälisen koulun opetusta muillakin Suomeen ja suomalaisuuteen liittyvillä sisällöillä. Osa ei käy muuta koulua kuin Kulkuria ja opiskelee kaikkia aineita.

Vaikka iso osa opilaista opiskelee vain yhtä ainetta, verkkokoulussa toteutetaan joka lukuvuosi koko koulun yhteinen, oppiainerajat ylittävä ilmiöprojekti. Ilmiöön tutustutaan eri näkökulmista koko lukuvuoden ajan. Työskentely huipentuu ilmiökuukausiin (maalis-huhtikuu), jolloin kaikilla oppilailla on mahdollisuus syventyä ilmiöön osana eri oppiaineiden kurssityöskentelyä.

Vuosittain vaihtuvan ilmiön teeman valintaan osallistuvat opettajat ja oppilaat. Oppilas valitsee sekä näkökulman, joka häntä ilmiössä kiinnostaa, että toteutustavan. Ilmiötuotokset dokumentoidaan ja kootaan koulun yhteisille ilmiösivuille.

Opettajat arvioivat ilmiötyöskentelyä osana oppilaan kurssisuoritusta kaikissa niissä aineissa, joita hän opiskelee ja joihin oppilaan valitsema näkökulma, työskentelytapa tai tuotos liittyy.