https://peda.net/id/71fc4444630 2022-03-05T10:53:21+02:00 https://peda.net/:static/532/peda.net.logo.bg.svg <div class="license">Tämän sivun lisenssi <a rel="license" href="https://peda.net/info">Peda.net-yleislisenssi</a></div> https://peda.net/id/f99c6d66630 2021-12-23T11:39:16+02:00 <b><span class="right"><a href="https://peda.net/p/myllyviita/OrbitaaliMarvinSketch2painos/6ma/molekyylin-liukoisuus-logp/jakaantumiskerroin-logp/logp-1.png#top" title="logP_1.png"><img src="https://peda.net/p/myllyviita/OrbitaaliMarvinSketch2painos/6ma/molekyylin-liukoisuus-logp/jakaantumiskerroin-logp/logp-1.png:file/photo/83e5fe31c84bd90e5680e0701693df2b39793972/logP_1.png" alt="" title="logP_1.png" class="inline" loading="lazy"/></a></span>Molekyylin liukoisuutta </b>voidaan tutkia <b>jakaantumiskertoimen avulla. </b>MarvinSketch antaa kyseisen arvon valinnalla: Calvulations | Partitioning | logP . Display Options -välilehdestä valitaan Type-kohdasta molemmat ja valitaan kohta <b>Display in MarvinSpace</b> (ominaisuus löytyy myös uusimmista MarvinSketch -ohjelmaversioista). <b>Kuva 1:</b> MarvinSketch-ohjelman valinnat.<br/> <b><br/> Jakaantumiskerroin</b> (P) kuvaa kemiassa ja farmasiassa aineen (kemiallisen yhdisteen, esimerkiksi lääkeaineen) <b>jakaantumista kahden kosketuksissa olevan ja toisiinsa sekoittumattoman nesteen</b> (yleensä vesifaasin ja orgaanisen faasin) <b>välillä</b>. Jakaantumiskerroin kuvaa aineen liukoisuutta ja affiniteettia kumpaankin liuottimeen. <br/> <br/> <b>Jakaantumiskerroin</b> lasketaan aineen konsentraatioiden suhteesta kumpaankin liuottimeen. Mitä suurempi on jakaantumiskerroin, sitä rasvaliukoisempi aine on. <br/> <br/> Orgaanisena faasina käytetään yleensä oktanolia. Tällöin jakaantumiskertoimesta käytetään nimitystä oktanoli/vesi-jakaantumiskerroin (Pow). Jakautumiskertoimen arvo ilmoitetaan usein <b>logaritmiarvona (logP)</b>, koska jakaantumiskertoimen vaihteluväli on suuri eri yhdisteillä (P = 0,0001 – 100 000). <b>logP-arvo kuvaa aineen rasvaliukoisuutta eli lipofiilisyyttä</b>.<br/> <br/> <b>Kuva 2:</b> MarvinSketch ja logP-arvo. Kuvassa tuotettu molekyylin rakenteen vaikutus rasvaliukoisuuteen.<br/> <a href="https://peda.net/p/myllyviita/OrbitaaliMarvinSketch2painos/6ma/molekyylin-liukoisuus-logp/jakaantumiskerroin-logp/jakaantumiskerroin1.png2#top" title="Jakaantumiskerroin1.png"><img src="https://peda.net/p/myllyviita/OrbitaaliMarvinSketch2painos/6ma/molekyylin-liukoisuus-logp/jakaantumiskerroin-logp/jakaantumiskerroin1.png2:file/photo/078eff33b17bbe45854e6534713405cf82d53b64/Jakaantumiskerroin1.png" alt="" title="Jakaantumiskerroin1.png" class="inline" loading="lazy"/></a><br/> <br/> Tässä kaksi poimintaa:<br/> <table border="1"> <tbody> <tr> <td>Molekyylit: etaani, eteeni, etanoli, etanaali ja etaanihappo</td> <td>Molekyylit: metyylipropaani, 2-buteeni, 2-butanoli, butenaali, butaanihappo</td> </tr> <tr> <td><a href="https://peda.net/p/myllyviita/OrbitaaliMarvinSketch2painos/6ma/molekyylin-liukoisuus-logp/jakaantumiskerroin-logp/logp-2.png#top" title="logP_2.png"><img src="https://peda.net/p/myllyviita/OrbitaaliMarvinSketch2painos/6ma/molekyylin-liukoisuus-logp/jakaantumiskerroin-logp/logp-2.png:file/photo/3e35a2f26c007978400786feda4c2f409feb9d90/logP_2.png" alt="" title="logP_2.png" class="inline" loading="lazy"/></a></td> <td><a href="https://peda.net/p/myllyviita/OrbitaaliMarvinSketch2painos/6ma/molekyylin-liukoisuus-logp/jakaantumiskerroin-logp/logp-3.png#top" title="logP_3.png"><img src="https://peda.net/p/myllyviita/OrbitaaliMarvinSketch2painos/6ma/molekyylin-liukoisuus-logp/jakaantumiskerroin-logp/logp-3.png:file/photo/fc67a767152291b8c7e83c27b78f6736fbc0e220/logP_3.png" alt="" title="logP_3.png" class="inline" loading="lazy"/></a></td> </tr> </tbody> </table> Tässä kannattaa huomata <b>elektronitiheyttä kuvaavat 3D-kuvat</b>. Vaikka MarvinSpace-ohjelma on uusista MarvinSketch-ohjelman versioista poistunut, sen ominaisuuksia on kuitenkin löydettävissä näistä erityistoiminnoista. Eri logP-arvojen vertailu ei ole lukion oppimäärän mukaista, joskin auttaa osaltaan ymmärtämään liukoisuutta ja niin myös eri molekyylien poolisuutta. 2021-12-22T12:00:21+02:00