Heikan koulussa toimii oppilaskunta, jolla on kaksi ohjaavaa opettajaa. Jokaisesta luokasta oppilaat ovat äänestäneet kaksi oppilaskunnan edustajaa, jotka osallistuvat kokouksiin noin kerran kuukaudessa. Kokouksissa käsitellään koko koulun toimintaan ja kouluviihtyvyyteen liittyviä asioita. Oppilaskunnan toiminta pyrkii edistämään oppilaiden osallistamista sekä yhteistyötaitoja. Oppilaskunnan edustajat voivat kokoontua varsinaisten kokousten välillä pienemmissä ryhmissä toteuttaakseen kokouksessa suunniteltuja projekteja.